美国加州大学戴维斯分校教授、EBP工作组主席HarrisL

  地球生物基因组计划(EBP)是一项旨在对地球上所有已知的动植物、真菌和原生生物基因组进行测序的全球合作计划,已于今年6月在美国科学院院刊(PNAS)发表计划白皮书。该计划于(11月1日)正式启动,来自全球各地的科学伙伴和资助者,齐聚英国伦敦,讨论该项目组织和资助的进展情况。中国方面主要是由深圳华大生命科学研究院院长及深圳国家基因库执行主任徐讯、华大生命科学研究院副院长刘心出席活动。EBP最终将为推动生物多样性保护和人类社会可持续发展创造新的基础。EBP的目标是在十年时间里对地球所有真核生物的基因组进行测序、编目和分类。EBP的预估成本为47亿美元(约合322亿人民币)。考虑到通货膨胀,人类基因组计划如果在今天进行将花费50亿美元。EBP是由于近期在测序和信息技术方面的进展得以实现的,这些进展将使全球各地的伙伴机构每年能够读取和解释数以万计物种的基因组。

  对地球生物多样性的进一步了解和有效管理地球资源是新千年最重要的科学和社会挑战之一。要克服这些挑战,就需要对地球上数百万个生物体的进化和相互作用有新的科学认识。

  目前,只有不到3500个(约占所有已知线%)的基因组进行了测序,高质量参考基因组不到100个。对所有已知的真核生物基因组进行测序,将彻底改变我们对生物学和进化的理解,促进保护和恢复生物多样性,为社会进步和人类发展带来新的契机。

  美国加州大学戴维斯分校教授、EBP工作组主席Harris Lewin表示:“地球生物基因组计划可视为新生物学的基础。有了路线图,所有真核生物的蓝图将成为了解生命规律、进化原理、保护稀有和濒危物种的新方法;为农业和医学领域的研究人员提供巨大新资源。”

  EBP在正式发布之前的最后一年里取得了非凡的进展。EBP已经成为现有大规模基因组项目及其全球真核生物伙伴机构的组织粘合剂。为此,包括美国、英国、中国、德国、丹麦、澳大利亚和巴西在内的全球17个机构签署了一项谅解备忘录,每一个机构都有义务为实现项目的共同目标而共同努力。预计随着项目的进展,将有更多的伙伴机构、组织和社区加入。

  预计从该项目中收集和产生的生物数据量将按百万兆计算,超过了Twitter、YouTube或天文学积累的数据。项目参与者在EBP谅解备忘录中同意,数据将存储在公共数据库中,并向全人类开放供研究之用。该项目将建立在已有物种基因组测序计划的成果之上。例如,洛克菲勒大学的Erich Jarvis主持的脊椎动物基因组计划。该计划旨在对现存66000种脊椎动物的基因组进行测序,目前公布了14个物种的基因组,包括蝙蝠、鱼、加拿大山猫和鸮鹦鹉。

  华大基因(中国深圳)也在该项目中发挥了重要作用,领导了万种植物基因组测序的工作,该项目的目标是完成10000种绿色植物的基因组;同时领导了万种鸟类基因组计划,已经完成超过300种鸟类基因组测序工作;另外还领导了全球蚂蚁基因组联盟的工作,该联盟的目标是对大约200个蚂蚁基因组进行测序。同样,美国农业部正在努力对农业经济重要的昆虫和螨类100个基因组进行测序。目前共有15个科学团体以及国家和区域项目附属于EBP计划。

  桑格研究所将主导EBP在英国的工作,对整个不列颠群岛的66000种真核生物进行测序,这个新项目被称为达尔文生命树项目。桑格致力于创建新的研究方案,称为生命之树方案,以履行这一使命,合作伙伴包括位于伦敦的自然历史博物馆、皇家植物园、丘园、厄勒姆研究所、EMBL-EBI和爱丁堡基因组学研究中心。EBP将帮助协调其他附属项目,以帮助减少冗余和最大限度地利用资源。

  桑格研究院院长MikeStratton说:“在全球范围内,超过半数的脊椎动物在过去40年中消失,23000个物种在不久的将来面临灭绝的威胁。利用我们将从所有真核物种的基因组中获得的生物学知识,主动承担地球生命的监护者的责任;在大自然面临巨大压力的时候,更明智地利用这些基因组来照料地球上的生命,尤其是来自我们的压力。”威尔科姆科学学院院长Jim Smith说:“当人类基因组计划在25年前开始时,我们无法想象当时产生的DNA序列是如何演变成今天的人类健康和疾病相关研究的。此时开始进行地球上所有生命的测序计划于此相同。从自然界中,我们将深入了解开发治疗传染病的新方法,确定减缓衰老的药物,产生养活世界的新方法,创造新的生物材料。”

  来自中国深圳华大基因的刘心博士说:“万种植物基因组项目(10KP)的目标是对代表地球上主要植物分支的一万多个基因组进行测序。该项目将在今后五年内产生大规模的植物基因组数据,解决有关植物进化的基本问题。地球生物基因组项目提供了一个框架,在该框架内可以有效地开展全球协作,从而使我们的项目得以实施。”

  华大基因于2017年7月第19届国际植物学大会期间启动万种植物基因组计划,目前已经收到来自世界十几个国家、几十家科研机构的参与,收到来自世界各地及深圳国家基因组采集样品超过1500份,已经完成超过1000种植物基因组评估,完成超过100种植物基因组组装。

  来自澳大利亚墨尔本拉筹伯大学的Jenny Graves教授说:“通过比较近缘种的基因组对揭示物种的近期变化和探索物种的遗传健康具有很大的潜力。比较远缘物种可以让我们回到过去发现最基本的生命过程是如何工作的,以及它们是如何进化的。你永远不知道下一个重大突破会从哪里来,所以对所有物种进行是十分有意义的。”

  美国史密森学会的W.John Kress博士说:“自然历史博物馆几个世纪以来一直在收集和储存有关自然世界的信息。地球生物基因组计划将使我们能够更全面地分析、综合和分享这些信息,部分地通过我们目前和将来居住在我们墙壁内的数十亿生物多样性标本。”

  悉尼大学的KatherineBelov教授说:“在今年早些时候完成的考拉基因组测序工作中,澳大利亚研究人员计划在未来五年内对澳大利亚50种最濒危的动物进行测序。这些基因组数据将为小的、孤立的有袋动物、两栖动物和鸟类种群的遗传管理提供基础。地球生物基因组计划使我们能够加入一个全球专家网络,利用他们的专门知识和计算管道,并以比单独工作更快的速度实现我们的目标。”

  厄尔汉姆研究所科学主任FedericaDi Palma教授说:“我们在哥伦比亚的全球合作框架工作正在表明,生物多样性对发展中国家和发达国家的气候变化情况是多么重要。随着这些国家适应新的政策格局和不断变化的政治挑战,学者、非政府组织、企业和决策者比以往任何时候都更需要联合起来,共同确定、保护和管理这种生物多样性,以促进可持续的经济增长和社会发展。”

  EBP项目是华大基因继人类基因组计划、千人基因组计划等国际大科学计划之后的又一个超大国际科学合作计划,特别是在华大基因领导的万种植物基因组计划项目和万种鸟类基因组计划项目方面发挥全世界的引领作用,展现华大基因在国际合作大科学项目的引领性。

  煜森资本成立于2016年,聚焦国际先进的生物医学科技,旨在打造一流的医疗健康创业和投融资平台。核心团队由一批业内资深企业家、投资人和职业经理人组成,拥有丰富的研发、管理、创业、投资和资本运作经验,并拥有深厚的行业资源。煜森资本核心业务,包括天使投资、共同创业、财务顾问和专项投资基金四大板块。煜森资本秉承“投资并与企业共成长”的理念,致力于成为企业的紧密合作伙伴,推动和协助企业共同发展,与投资和服务的企业携手构建中国医疗健康新生态。